ISSN 2953-6367  
http://revistainvestigo.com  
Julio - diciembre 2026  
Vol. 7 No. 20, PP. 101-120  
https://doi.org/10.56519/wwfxfs82  
HERRAMIENTAS BIOTECNOLÓGICAS APLICADAS A LA  
CONSERVACIÓN DE HÁBITATS EN LATINOAMERICA: ENFOQUE  
EN LA AMAZONÍA ECUATORIANA Y LOS BOSQUES ANDINOS  
COMO ESPACIOS DE CONECTIVIDAD ECOLÓGICA  
BIOTECHNOLOGICAL TOOLS APPLIED TO HABITAT  
CONSERVATION IN LATIN AMERICA: FOCUS ON THE  
ECUADORIAN AMAZON AND THE ANDEAN FORESTS AS SPACES  
OF ECOLOGICAL CONNECTIVITY  
Bayron Andrés Romero Chacha1, Jessica Arcos Logroño2, Alex Rolando Moyota Paguay3,  
Goering Octavio Zambrano Cárdenas4  
{bayron.romero@espoch.edu.ec1, paola.arcos@espoch.edu.ec2, goering.zambrano@espoch.edu.ec3, alex.moyota@espoch.edu.ec4}  
Fecha de recepción: 11/05/2026 / Fecha de aceptación: 16/06/2026  
/ Fecha de publicación: 08/07/2026  
RESUMEN: La conservación de hábitats en América Latina enfrenta presiones crecientes  
asociadas a la fragmentación del paisaje, la pérdida de biodiversidad, la reducción de la  
conectividad ecológica y la intervención humana sobre ecosistemas estratégicos. En torno a lo  
planteado, la biotecnología representa un apoyo importante para fortalecer las acciones de  
conservación, al ofrecer herramientas más precisas para el monitoreo de especies, la  
identificación taxonómica, el análisis de diversidad genética y la restauración de hábitats  
degradados. El presente artículo de revisión bibliográfica analiza las principales herramientas  
biotecnológicas aplicadas a la conservación de hábitats en América Latina, con énfasis en  
Ecuador, la Amazonía ecuatoriana y los bosques andinos como espacios clave de conectividad  
ecológica. Para ello, se realizó una búsqueda y selección de literatura científica mediante el  
método PRISMA. De los artículos revisados, los temas más prevalentes fueron corredores  
ecológicos y conectividad (21,6 %), mamíferos grandes o especies paisaje (16,2 %), genómica de  
la conservación (13,5 %) y genética en general (10,8 %). En menor proporción se identificaron  
estudios sobre ADN ambiental, metabarcoding, códigos de barras de ADN, biobancos,  
criopreservación y monitoreo de biodiversidad. Esta información da a conocer que estas  
1Estudiante de la Carrera de Ingeniería Ambiental – Escuela Superior Politécnica de Chimborazo (ESPOCH) – Sede Morona  
Santiago, https://orcid.org/0009-0007-7814-6850  
2Escuela Superior Politécnica de Chimborazo (ESPOCH), Sede Morona Santiago, Don Bosco y Juan Felix Pintado, Macas 140101,  
Ecuador, https://orcid.org/0000-0002-9462-2219  
3Escuela Superior Politécnica de Chimborazo (ESPOCH), Sede Morona Santiago, Don Bosco y Juan Felix Pintado, Macas 140101,  
Ecuador, https://orcid.org/0000-0001-6975-8539  
4Escuela Superior Politécnica de Chimborazo (ESPOCH), Sede Morona Santiago, Don Bosco y Juan Felix Pintado, Macas 140101,  
Ecuador, https://orcid.org/0009-0008-4864-7643  
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Revista Científica Multidisciplinaria InvestiGo  
Riobamba – Ecuador  
Cel: +593 97 911 9620  
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AMAZONÍA ECUATORIANA Y LOS BOSQUES ANDINOS COMO ESPACIOS DE CONECTIVIDAD ECOLÓGICA  
herramientas contribuyen a fortalecer las líneas base taxonómicas y genéticas, detectar  
especies difíciles de registrar, evaluar conectividad entre poblaciones y orientar acciones de  
restauración. Sin embargo, su aplicación aún enfrenta limitaciones relacionadas con bibliotecas  
de referencia incompletas, infraestructura, financiamiento, formación técnica y articulación  
con la gestión ambiental. De tal manera que, la biotecnología posee un alto potencial para  
apoyar la conservación y restauración de hábitats, siempre que se integre con métodos  
convencionales, políticas públicas, gobernanza territorial y acciones efectivas de protección del  
territorio.  
Palabras clave: biotecnología, conservación de hábitats, biodiversidad, ADN ambiental,  
genómica de la conservación  
ABSTRACT: Habitat conservation in Latin America faces growing pressures associated with  
landscape fragmentation, biodiversity loss, reduced ecological connectivity, and human  
intervention in strategic ecosystems. In this context, biotechnology represents an important  
support for strengthening conservation actions by offering more precise tools for species  
monitoring, taxonomic identification, genetic diversity analysis, and the restoration of  
degraded habitats. This bibliographic review article analyzes the main biotechnological tools  
applied to habitat conservation in Latin America, with emphasis on Ecuador, the Ecuadorian  
Amazon, and the Andean forests as key areas of ecological connectivity. To this end, a search  
and selection of scientific literature was carried out using the PRISMA method. From the  
reviewed literature, the most prevalent topics were ecological corridors and connectivity  
(21.6%), large mammals or landscape species (16.2%), conservation genomics (13.5%), and  
genetics in general (10.8%). To a lesser extent, studies on environmental DNA, metabarcoding,  
DNA barcoding, biobanks, cryopreservation, and biodiversity monitoring were identified. The  
results show that these tools contribute to strengthening taxonomic and genetic baselines,  
detecting species that are difficult to record, evaluating connectivity among populations, and  
guiding restoration actions. However, their application still faces limitations related to  
incomplete reference libraries, infrastructure, funding, technical training, and coordination  
with environmental management. It is concluded that biotechnology has high potential to  
support habitat conservation and restoration, if it is integrated with conventional methods,  
public policies, territorial governance, and effective actions for territorial protection.  
Keywords: biotechnology, habitat conservation, biodiversity, environmental DNA, conservation  
genomics  
INTRODUCCIÓN  
Frente a la crisis actual por la pérdida de biodiversidad, siendo esta altamente influenciada por el  
cambio climático global y las actividades antropogénicas, es de gran importancia el hecho de  
integrar y simplificar las diversas herramientas científicas presentes hoy en día (1). Esta pérdida  
no debe entenderse únicamente como una disminución en el número de especímenes por  
especie, sino también como el deterioro de hábitats y la reducción de la diversidad genética  
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dentro de las poblaciones, la cual es uno de los componentes claves para la conservación de la  
biodiversidad (2) Siendo la diversidad genética clave en la adaptabilidad y supervivencia de las  
especies frente a cambios ambientales, enfermedades y otras presiones antrópicas a las que  
puedan verse expuestos (3) En este contexto, estudios recientes advierten que la diversidad  
genética está disminuyendo en numerosas especies a escala mundial, lo que refuerza la necesidad  
de fortalecer estrategias de conservación más integrales y genéticamente informadas (2).  
Esta problemática también ha puesto evidencia una consecuencia adicional, la pérdida y la  
fragmentación de hábitats, especialmente los ecosistemas selváticos y boscosos (forestales).  
Estos procesos suelen aislar y dividir poblaciones silvestres, limitar su conectividad y reducir de  
manera significativa el intercambio de genes entre ellas (4,5) Investigaciones realizadas en  
grandes mamíferos como el jaguar, el tigre y el león han revelado que el aislamiento poblacional  
se relaciona con consecuencias negativas como el aumento de la endogamia, la reducción del  
flujo génico y la erosión genómica (6,7).  
Sin embargo, la problemática no requiere solo de la evidencia científica, sino que también integra  
marcos sociopolíticos y de gestión/gobernanza territorial. Siendo así, procesos claves para la  
toma de decisiones y políticas públicas. Mostrando una visión donde se exige que investigadores,  
gestores de conservación, responsables en la toma de decisiones, políticos, legisladores y la  
comunidad, colaboren en buscar objetivos comunes donde la preservación de la biodiversidad  
sea responsabilidad de todos (1). En torno a esta perspectiva han nacido los corredores  
ecológicos, los cuales permiten reconectar fragmentos de hábitat, facilitar el desplazamiento de  
las especies y mantener procesos como el flujo génico entre las poblaciones silvestres (8,9).  
Estos corredores ecológicos no solo son espacios naturales o franjas de vegetación, sino también  
como instrumentos de planificación territorial, ya que en muchos de los sectores que se  
consideran parte de un corredor habitan pueblos originarios (10,11) En Ecuador, un estudio  
desarrollado en el Corredor Ecológico Llanganates – Sangay demuestra que la conectividad para  
especies como el tapir de montaña requiere registrar información científica en procesos de tipo  
participativo, de tal manera que se consideren áreas privadas, vegetación, caminos, densidad  
poblacional y la conservación (12). Por ello, la existencia de corredores ecológicos no solo  
responde a criterios biológicos, sino también a marcos sociopolíticos capaces de ordenar el  
territorio, reducir conflictos entre la conservación y el desarrollo (persona – fauna), y sobre todo  
que las estrategias de conservación empleadas se acomoden a un largo plazo.  
La relevancia biológica de Latinoamérica se explica por su alta concentración de biodiversidad y  
por la presencia de varios hotspots de importancia global, lo que convierte a la región en un  
espacio estratégico para la conservación de especies, ecosistemas y recursos genéticos (1,13). En  
este contexto, la brecha en la aplicación de la genética de la conservación ha sido documentada  
en distintos estudios, los cuales identifican cuatro barreras principales: a) la falta de mecanismos  
eficientes para la transferencia de conocimientos entre la comunidad académica y los actores  
involucrados; b) la escasa capacitación formal para interpretar y evaluar datos genéticos; c) los  
altos costos iniciales y la necesidad de financiamiento a largo plazo en estudios genéticos; y d) las  
estructuras burocráticas o restricciones impuestas por las instituciones gubernamentales  
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pertinentes (1). Sin embargo, a pesar de esta riqueza natural, la conservación regional todavía  
enfrenta limitaciones importantes en la incorporación y aplicación plena de herramientas  
científicas y tecnológicas disponibles, como la genética de conservación, el monitoreo mediante  
teledetección y los biobancos de material biológico (1,13,14).  
De manera conjunta, los datos recabados permiten comprender que la conservación no solo debe  
limitarse a la protección de especies o reservas naturales aisladas, sino que requiere integrar  
herramientas biotecnológicas, genómicas y territoriales que permitan analizar la diversidad  
genética, la conectividad ecológica (corredores ecológicos) y las presiones antropogénicas; por  
ende se evidencia la necesidad imperativa de aplicar estrategias más activas e informadas por la  
academia (2).  
Por tanto, los corredores ecológicos adquieren un papel fundamental no solo como espacios de  
conexión entre hábitats fragmentados, sino también como un instrumento de planificación  
territorial que dependen de una adecuada gobernanza y participación comunitaria (10,12) Bajo  
este enfoque, se tuvo como objetivo analizar las principales herramientas biotecnológicas que se  
aplican a la conservación de hábitats en Latinoamérica, tomando como eje de análisis la Amazonía  
ecuatoriana y los bosques andinos por su importancia en la conectividad ecológica.  
MATERIALES Y MÉTODOS  
La presente investigación se realizó como una revisión bibliográfica sistematizada, enfocada en  
analizar las principales herramientas biotecnológicas aplicadas a la conservación de hábitats en  
Latinoamérica, con especial atención en la Amazonía ecuatoriana y los bosques andinos como  
espacios importantes para la conectividad ecológica. Para ordenar el proceso de búsqueda,  
selección e inclusión de los estudios, se tomó como referencia la metodología PRISMA 2020, ya  
que permite presentar de forma más clara las etapas de identificación, cribado, elegibilidad e  
inclusión de la literatura científica.  
La búsqueda de información se llevó a cabo en bases de datos académicas y repositorios  
científicos como Scopus, Web of Science, ScienceDirect, SpringerLink, PubMed, Google Scholar,  
Frontiers, PLOS ONE, Nature y Scientific Reports. Se priorizaron artículos publicados entre 2021 y  
2026, con el fin de trabajar principalmente con literatura reciente. Sin embargo, también se  
consideraron algunos estudios metodológicos previos cuando aportaban bases necesarias para  
comprender el uso de herramientas moleculares y enfoques relacionados con la conectividad  
ecológica.Para la búsqueda se utilizaron palabras clave en español e inglés, relacionadas  
directamente con el tema de estudio. Entre los términos empleados estuvieron: conservation  
genomics, conservation genetics, environmental DNA, eDNA, DNA barcoding, metabarcoding,  
cryopreservation, habitat conservation, ecological corridors, habitat fragmentation, gene flow,  
connectivity, Latin America, Ecuador, Ecuadorian Amazon, Andean forests, genómica de la  
conservación, ADN ambiental, código de barras de ADN, corredores y restauración ecológicos.  
Estas palabras permitieron localizar estudios vinculados tanto con herramientas biotecnológicas  
específicas como con su aplicación en conservación de hábitats y paisajes fragmentados.  
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Se incluyeron artículos científicos, revisiones y estudios de caso publicados en revistas  
académicas que abordaran herramientas biotecnológicas aplicadas a la conservación de la  
biodiversidad, monitoreo molecular, diversidad genética, conectividad ecológica, restauración de  
hábitats o gestión territorial. También se tomaron en cuenta investigaciones desarrolladas en  
Latinoamérica y estudios específicos de Ecuador, especialmente aquellos relacionados con la  
Amazonía ecuatoriana, Yasuní, ecosistemas dulceacuícolas, bosques andinos y corredores  
ecológicos. En cambio, se excluyeron documentos sin respaldo académico, publicaciones  
duplicadas, textos que no se relacionaban directamente con el tema, estudios centrados  
exclusivamente en genética humana, medicina, agricultura productiva o biotecnología sin vínculo  
claro con la conservación de hábitats.  
El proceso de selección siguió las fases establecidas por PRISMA. En la etapa de identificación se  
recuperaron 96 registros. Luego, durante la depuración inicial, se eliminaron 14 documentos  
duplicados, por lo que quedaron 82 estudios para la fase de cribado. Después de revisar títulos y  
resúmenes, se excluyeron 31 registros por no guardar relación directa con el objetivo del artículo.  
De esta manera, 51 documentos pasaron a la fase de elegibilidad. En esta etapa se revisaron los  
textos completos y se descartaron 13 documentos por ausencia de enfoque biotecnológico, baja  
pertinencia temática o regional, falta de acceso al texto completo o redundancia temática.  
Finalmente, se incluyeron 38 estudios únicos en la revisión bibliográfica.  
Además, se realizó una evaluación cualitativa de la evidencia seleccionada. Para ello, se  
consideraron aspectos como la publicación en revistas revisadas por pares, la actualidad de la  
fuente, la claridad metodológica, la pertinencia temática y la relación directa con la conservación  
de hábitats, la conectividad ecológica y el contexto latinoamericano o ecuatoriano.  
Posteriormente, la información fue organizada en una matriz bibliográfica que incluyó datos  
como autor, año, región de estudio, herramienta biotecnológica, ecosistema analizado,  
principales resultados y aporte al tema. Esta organización permitió comparar los estudios  
revisados y construir una síntesis crítica de la literatura, verificando que las fuentes seleccionadas  
respondieran al objetivo del artículo y al enfoque planteado sobre Latinoamérica, la Amazonía  
ecuatoriana y los bosques andinos.  
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Figura 1. Diagrama de flujo del proceso de selección de estudios según la metodología PRISMA.  
Fuente: Elaboración propia.  
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RESULTADOS  
Avances, aplicaciones y desafíos en el contexto latinoamericano  
En la Amazonía y la Orinoquía colombiana actualmente se necesitan herramientas moleculares  
rápidas, sensibles, no invasivas y de bajo costo, una demanda especialmente importante en  
regiones megadiversas, donde los inventarios tradicionales suelen requerir más tiempo y recursos  
(15). En este contexto, su investigación demostró que el eDNA y la secuenciación de nueva  
generación amplían la detección de vertebrados en paisajes tropicales complejos.  
En Ecuador, su uso también empieza a consolidarse. Al estudiar corrientes andinas y amazónicas,  
sobre todo, en el Neotrópico, la rapidez de aplicación y una mayor precisión son esenciales frente  
al deterioro acelerado de los ecosistemas dulceacuícolas (16). Sin embargo, advierten que el  
metabarcoding aún debe emplearse como complemento de los métodos tradicionales de  
identificación, debido a que las bibliotecas de referencia de ADN para muchos taxones  
ecuatorianos todavía son incompletas. Esto pone en evidencia una realidad importante del  
contexto ecuatoriano: aunque ya existen avances metodológicos, su verdadero alcance aún  
depende del fortalecimiento de las bases de datos, de las capacidades técnicas y de una mejor  
articulación institucional (16).  
Una situación semejante se observa en los ecosistemas terrestres de alta montaña, en un estudio  
sobre el oso andino en Ecuador desarrollaron una herramienta molecular económica y de fácil  
uso para analizar la diversidad genética y la conectividad. No obstante, los autores también  
reconocen que las amenazas que enfrenta esta especie en el país siguen siendo severas y que  
difícilmente disminuirán sin intervenciones directas(17). En conjunto, estos estudios muestran  
que el avance más importante en la región no radica solo en la aparición de nuevas técnicas, sino  
en su aplicación progresiva a problemas concretos de conservación. Al mismo tiempo, dejan claro  
que, en países como Ecuador, el reto principal continúa siendo transformar estos avances en  
decisiones efectivas frente a la fragmentación del hábitat, la deforestación y la limitada  
infraestructura disponible para el monitoreo biológico (16,17).  
Un estudio en 2024 refleja que una de las principales barreras sigue siendo la escasa transferencia  
de conocimiento entre la academia y las comunidades, lo que explica por qué muchos avances  
moleculares todavía no se reflejan con rapidez en políticas o estrategias concretas(1). En Ecuador,  
esta limitación se observa con claridad en los ecosistemas de agua dulce, en estos se encontraron  
vacíos importantes en las bibliotecas de referencia de ADN, por lo que recomiendan que el  
metabarcoding siga utilizándose junto con los métodos tradicionales. De forma similar, otros  
investigadores concluyeron que las poblaciones de oso andino en Ecuador deben manejarse por  
separado, aunque advierten que las amenazas sobre la especie continúan siendo fuertes si no se  
aplican intervenciones directas(16,17). De tal forma que, estos estudios muestran que el reto no  
es solo contar con técnicas más modernas, sino lograr que la información genética y molecular  
sirva realmente para orientar decisiones de manejo, fortalecer la conectividad y responder las  
diferentes problemáticas.  
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Conforme a lo expuesto, la literatura evidencia que el principal desafío en la región no es  
únicamente técnico/aplicativo, sino también institucional y operativo, ya que aún persiste la falta  
de mecanismos eficientes para la transferencia de conocimiento dentro y fuera de la academia  
(18). En Ecuador, esta realidad se refleja en la necesidad de fortalecer las bibliotecas de referencia  
molecular, ya que la línea base genética de varios grupos biológicos todavía es incompleta y limita  
la identificación precisa de especies en estudios de biodiversidad (19). Asimismo, los métodos  
moleculares no deben reemplazar totalmente a los enfoques convencionales, sino  
complementarlos, debido a que la combinación de ADN ambiental y técnicas tradicionales de  
campo puede mejorar la detección de especies y generar información más robusta para la  
conservación, como se ha evidenciado en estudios realizados en la Amazonía ecuatoriana (20). En  
este sentido, la biotecnología no debe considerarse una solución aislada, sino una herramienta  
estratégica que puede fortalecer la conservación regional siempre que se articule con acciones  
directas de manejo, políticas públicas, capacidades locales y protección efectiva del territorio (21–  
23).  
Principales herramientas biotecnológicas empleadas en la conservación de hábitats  
Entre las herramientas biotecnológicas aplicadas a la conservación de hábitats, la genómica de la  
conservación se ha consolidado como una de las más importantes, debido a que permite analizar  
la diversidad genética de las poblaciones, reconocer su estructura, estimar niveles de conectividad  
y detectar señales de aislamiento o reducción del flujo génico. A diferencia de los enfoques  
genéticos tradicionales, la genómica trabaja con una mayor cantidad de información del ADN, lo  
que facilita una comprensión más detallada del estado de las poblaciones y de su capacidad para  
responder frente a procesos como la fragmentación, la pérdida de hábitat y el cambio ambiental.  
En este sentido, los genomas de referencia y los recursos genómicos públicos representan una  
base técnica importante para mejorar el monitoreo de la biodiversidad, orientar acciones de  
restauración y respaldar decisiones de manejo con evidencia científica (24) Además, distintos  
estudios señalan que la información genómica puede contribuir directamente a la planificación  
de acciones prácticas, como la identificación de unidades de conservación, el diseño de programas  
de translocación, el manejo de poblaciones amenazadas y la priorización de áreas críticas para  
conservar la conectividad ecológica (25). Sin embargo, su aplicación no debe reducirse  
únicamente a la generación de datos moleculares, ya que los genomas de referencia por sí solos  
no capturan toda la diversidad de una especie; por ello, deben integrarse con datos poblacionales,  
ecológicos y territoriales que permitan construir estrategias de conservación más completas y  
aplicables a la realidad de cada ecosistema (26,27).  
En la Amazonía ecuatoriana, los estudios revisados muestran que las herramientas moleculares  
pueden aportar información clave para fortalecer la planificación y el monitoreo de zonas con alta  
biodiversidad. Un ejemplo claro se observa en la microcuenca del río Tena, donde la combinación  
de ADN ambiental y censos visuales permitió identificar 33 especies de anfibios acuáticos,  
incluyendo algunas que fueron detectadas únicamente mediante eDNA. Esto demuestra que esta  
herramienta puede ser muy útil en ambientes tropicales, donde la observación directa muchas  
veces se dificulta por la cobertura vegetal, el comportamiento de las especies o las condiciones  
propias del terreno (20). De forma similar, en el Parque Nacional Yasuní se actualizó el inventario  
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de peces de agua dulce, registrándose 458 especies distribuidas en 47 familias y 13 órdenes. Entre  
las especies reportadas se encuentran peces representativos de la Amazonía como Arapaima  
gigas, Colossoma macropomum, Osteoglossum bicirrhosum, Pseudoplatystoma fasciatum,  
Pseudoplatystoma tigrinum y Phractocephalus hemioliopterus (18). Esta información es  
importante porque fortalece las bases taxonómicas necesarias para futuras aplicaciones de código  
de barras de ADN, metabarcoding y ADN ambiental, herramientas que dependen de bibliotecas  
de referencia completas y de identificaciones confiables. Asimismo, el redescubrimiento de  
Rhyacoglanis pulcher en el río Villano, dentro de la cuenca del Napo, muestra que la combinación  
entre taxonomía tradicional y herramientas moleculares puede ayudar a confirmar registros de  
especies raras o poco documentadas, reduciendo vacíos de información sobre la biodiversidad  
amazónica ecuatoriana (40).  
Estas herramientas también pueden aportar a la planificación de corredores ecológicos,  
especialmente en un país como Ecuador, donde la pérdida de cobertura boscosa y la  
fragmentación han afectado la conectividad funcional de varios ecosistemas. Estudios recientes  
evidencian que los bosques continentales ecuatorianos han perdido conectividad entre 1990 y  
2018, principalmente por los cambios de uso del suelo y la expansión agrícola (29). Esta  
problemática también se observa en ecosistemas como el bosque seco tropical, donde la  
fragmentación reduce la continuidad del paisaje y hace necesario plantear procesos de  
restauración que no solo aumenten la cobertura vegetal, sino que también recuperen conexiones  
funcionales entre los parches de hábitat (28). En este contexto, los estudios sobre el Corredor de  
Conectividad Llanganates-Sangay muestran que la conservación de hábitats requiere integrar  
análisis espaciales, modelamiento de conectividad, especies paisaje y participación territorial,  
como se ha planteado para el tapir de montaña y para la proyección de cambios de uso y cobertura  
del suelo hacia 2030 (30,31). De manera similar, el diseño de corredores para el oso de anteojos  
entre el Parque Nacional Cayambe-Coca y la Reserva Ecológica Antisana demuestra que los  
modelos de distribución de hábitat y las rutas de menor costo pueden ayudar a identificar zonas  
prioritarias para mantener la movilidad de especies amenazadas (31). Por esta razón, en el  
contexto ecuatoriano, la biotecnología debe entenderse como un apoyo estratégico que, al  
combinarse con monitoreo de campo, cámaras trampa, análisis genéticos y planificación  
territorial, puede fortalecer la conservación de hábitats amazónicos, andinos y de bosques secos,  
favoreciendo la conectividad ecológica y la permanencia de poblaciones silvestres a largo plazo  
(17,20,32).  
Otra herramienta relevante para la conservación de hábitats es el código de barras de ADN, una  
técnica que permite identificar especies mediante secuencias cortas y estandarizadas del material  
genético (34). Su importancia no se limita solo a la identificación taxonómica, ya que también  
permite fortalecer bibliotecas de referencia, reconocer especies crípticas, reducir vacíos de  
información y mejorar el monitoreo de la biodiversidad en regiones megadiversas. En América  
Latina, esta herramienta resulta especialmente valiosa porque muchos ecosistemas tropicales  
presentan una gran riqueza biológica, pero todavía cuentan con una baja representación genética  
en bases de datos públicas. Un caso reciente se observa en la Amazonía peruana, donde se  
implementaron laboratorios descentralizados con tecnología portátil de secuenciación por  
nanoporos y se generaron 1.858 códigos de barras de ADN a partir de vertebrados y plantas,  
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fortaleciendo así las capacidades locales de investigación molecular (33). En Ecuador, esta  
necesidad también se refleja en estudios sobre peces del Chocó-Darién, donde el uso de códigos  
de barras de ADN permitió registrar especies nativas e introducidas, además de mejorar la línea  
base molecular para futuras acciones de conservación (19). Por ello, el código de barras de ADN  
debe entenderse no solo como una técnica de identificación, sino como una herramienta que  
puede fortalecer la investigación local y aportar información útil para la conservación de hábitats  
tropicales.  
Finalmente, la conservación de hábitats no solo necesita herramientas orientadas al monitoreo  
de especies en campo, como la genómica, el eDNA o los códigos de barras de ADN, sino también  
estrategias que permitan conservar material genético cuando las poblaciones naturales se  
encuentran bajo amenaza. En este sentido, la criopreservación es una herramienta biotecnológica  
ex situ importante para la conservación vegetal, ya que permite almacenar semillas, embriones,  
meristemos, polen u otros tejidos a temperaturas ultrabajas, reduciendo la actividad metabólica  
y manteniendo la viabilidad del germoplasma por largos periodos. Esta técnica es especialmente  
útil en especies con semillas sensibles a la desecación, baja regeneración natural o reproducción  
limitada, debido a que no siempre pueden conservarse de manera adecuada en bancos de  
semillas convencionales (35,36). De esta forma, la criopreservación no reemplaza la conservación  
in situ ni la protección directa de los ecosistemas, pero sí funciona como un respaldo estratégico  
frente a la pérdida acelerada de hábitats. Además, permite conservar diversidad genética vegetal  
y disponer de material biológico para futuros programas de propagación, restauración ecológica  
y recuperación de especies amenazadas (37,38). Por tanto, dentro de una estrategia integral de  
conservación, esta herramienta debe articularse con bancos de germoplasma, jardines botánicos,  
investigación genética, políticas públicas y acciones territoriales que garanticen tanto la  
protección del hábitat como la permanencia del material genético a largo plazo.  
Aplicaciones de la biotecnología en ecosistemas estratégicos y en la restauración de hábitats  
degradados en Ecuador y la Amazonía ecuatoriana  
Las aplicaciones de la biotecnología en ecosistemas estratégicos adquieren especial relevancia en  
la Amazonía, donde la alta diversidad biológica coincide con presiones asociadas a la  
deforestación, la fragmentación del bosque, la expansión vial y las actividades extractivas. En este  
escenario, las herramientas moleculares no deben entenderse como sustitutos absolutos de los  
inventarios ecológicos tradicionales, sino como métodos de apoyo que permiten ampliar la  
capacidad de detección de especies y generar información más precisa para la conservación y  
restauración de hábitats. Un ejemplo claro se observa en la microcuenca del río Tena, donde  
investigadores demostraron que la combinación de ADN ambiental (eDNA) y censos visuales  
permitió registrar 33 especies de anfibios acuáticos, incluyendo especies detectadas únicamente  
mediante eDNA (20). Este resultado evidencia que, en hábitats tropicales de difícil acceso, la  
integración de técnicas moleculares y métodos convencionales puede fortalecer las líneas base  
de biodiversidad y mejorar el monitoreo de organismos sensibles a los cambios ambientales.  
La necesidad de aplicar estas herramientas se vuelve más evidente frente a la fragmentación de  
la selva amazónica ecuatoriana. En un estudio, se analizaron las zonas prioritarias REDD+ de la  
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Amazonía ecuatoriana entre 1990 y 2022, y encontraron un aumento general de la fragmentación,  
expresado en mayor número de parches, incremento del aislamiento y reducción del tamaño y  
representatividad de la cobertura natural (39). Además, identificaron un patrón de fragmentación  
asociado al corredor norte-sur de la carretera E45, el cual contribuye a separar ecosistemas  
andinos y amazónicos. Estos hallazgos muestran que la conservación y la restauración no pueden  
planificarse de manera general, sino a partir de información espacial, ecológica y molecular que  
permita ubicar sectores críticos, reconocer zonas donde se pierde conectividad y priorizar  
intervenciones dirigidas a recuperar la integridad del paisaje.  
Otro aspecto fundamental para la conservación de hábitats en la Amazonía ecuatoriana es la  
construcción de líneas base taxonómicas y genéticas confiables. En el Parque Nacional Yasuní,  
Escobar-Camacho et al. (19) actualizaron el inventario de peces de agua dulce y registraron 458  
especies distribuidas en 47 familias y 13 órdenes, superando listados previos para esta área  
protegida. Este tipo de información es estratégica porque el uso posterior de técnicas como el  
código de barras de ADN, el metabarcoding o el eDNA depende de bibliotecas de referencia bien  
alimentadas y de identificaciones taxonómicas consistentes (19). En ecosistemas altamente  
diversos como Yasuní, mejorar estas bases no solo amplía el conocimiento científico, sino que  
también facilita la detección temprana de cambios en las comunidades biológicas, la identificación  
de especies poco registradas y el diseño de medidas de conservación ajustadas a las condiciones  
reales del hábitat.  
La utilidad de combinar enfoques tradicionales y moleculares también se evidencia en el registro  
de especies raras o escasamente documentadas. En el río Villano, dentro de la cuenca del Napo,  
Chuctaya et al. (40) reportaron el redescubrimiento de Rhyacoglanis pulcher después de casi 140  
años, mediante la identificación morfológica del ejemplar y la obtención de su secuencia de  
código de barras de ADN (40). Aunque se trata de un caso puntual, su importancia para la  
conservación es considerable, porque demuestra que la integración entre taxonomía clásica y  
herramientas moleculares puede validar registros, reducir incertidumbres y aportar evidencia  
sobre especies que podrían pasar desapercibidas en ambientes amazónicos de alta diversidad. En  
este sentido, la biotecnología contribuye a que la pérdida de hábitat no avance más rápido que el  
conocimiento disponible sobre las especies presentes en el territorio.  
En conjunto, los resultados evidencian que las herramientas biotecnológicas analizadas no deben  
entenderse como técnicas aisladas, sino como recursos complementarios dentro de una  
estrategia integral de conservación. La genómica, el ADN ambiental, el código de barras de ADN,  
el metabarcoding y la criopreservación permiten mejorar la identificación de especies, fortalecer  
líneas base taxonómicas y genéticas, detectar organismos difíciles de registrar y conservar  
material genético útil para futuros procesos de restauración. En el caso ecuatoriano, su aporte  
resulta especialmente relevante en ecosistemas estratégicos como la Amazonía, los Andes, Yasuní  
y los corredores de conectividad, donde la fragmentación, la pérdida de hábitat y los vacíos de  
información todavía limitan la toma de decisiones. No obstante, los hallazgos también muestran  
que su efectividad depende de la integración con métodos convencionales de campo, bases de  
referencia más completas, capacidades locales, planificación territorial y acciones directas de  
manejo. Por tanto, la biotecnología representa un apoyo estratégico para la conservación y  
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restauración de hábitats degradados, siempre que se articule con políticas públicas, gobernanza  
ambiental y protección efectiva del territorio.  
La siguiente tabla resume las aplicaciones, ventajas, limitaciones y costos estimados de las  
herramientas biotecnológicas más relevantes para la conservación de hábitats.  
Tabla 1. Aplicaciones, ventajas, limitaciones y costos estimados de las herramientas biotecnológica  
Herramienta  
Criterio  
Síntesis comparativa  
Aplicación  
Analiza diversidad genética, estructura poblacional, flujo génico,  
aislamiento y conectividad.  
Ventajas  
Identifica unidades de conservación, poblaciones vulnerables y áreas  
prioritarias para manejo, restauración o conectividad ecológica.  
Genómica de la  
conservación  
Limitaciones  
Requiere muestras de calidad, laboratorios especializados,  
bioinformática y personal capacitado. Un genoma de referencia no  
representa toda la diversidad de una especie.  
Costo  
Alto  
Referencias  
Aplicación  
(24–27)  
Detecta especies a partir de agua, suelo o sedimento, sin observarlas o  
capturarlas directamente.  
Ventajas  
Es no invasivo y útil en ecosistemas acuáticos, selvas tropicales y zonas  
de difícil acceso. Puede detectar especies raras o poco visibles.  
ADN ambiental  
Limitaciones  
Depende de bibliotecas de referencia completas y puede afectarse por  
contaminación, degradación del ADN o condiciones ambientales. No  
siempre estima abundancia real.  
Costo  
Medio a alto  
(15,16,20)  
Referencias  
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Herramienta  
Criterio  
Síntesis comparativa  
Aplicación  
Identifica comunidades biológicas completas mediante secuenciación  
masiva de ADN presente en una muestra.  
Ventajas  
Analiza varios grupos de organismos a la vez y fortalece el biomonitoreo  
en ríos, quebradas y ambientes tropicales.  
Metabarcoding  
Limitaciones  
Puede presentar sesgos por marcadores, errores de amplificación o  
bases incompletas. En Ecuador debe complementarse con identificación  
morfológica.  
Costo  
Medio a alto  
(16,20)  
Referencias  
Aplicación  
Identifica especies mediante secuencias cortas y estandarizadas del  
material genético.  
Ventajas  
Fortalece líneas base taxonómicas, reconoce especies crípticas o poco  
documentadas y mejora bibliotecas de referencia para eDNA o  
metabarcoding.  
Código de barras  
de ADN  
Limitaciones  
Requiere secuencias confiables. Su precisión disminuye cuando especies  
locales no están representadas en bases genéticas.  
Costo  
Medio  
Referencias  
Aplicación  
(18,19,34,40)  
Conserva semillas, embriones, polen, meristemos u otros tejidos  
vegetales a temperaturas ultrabajas.  
Criopreservación  
Ventajas  
Resguarda material genético a largo plazo, especialmente de especies  
amenazadas o no aptas para bancos convencionales. Apoya restauración  
futura.  
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Herramienta  
Criterio  
Síntesis comparativa  
Limitaciones  
Requiere infraestructura especializada, protocolos por especie y  
mantenimiento técnico. No reemplaza la conservación directa del  
hábitat.  
Costo  
Alto  
Referencias  
(35–38)  
En conjunto, la tabla muestra que ninguna herramienta actúa de manera aislada. Su mayor  
utilidad se alcanza cuando se integran métodos moleculares, trabajo de campo, bases de  
referencia confiables y planificación territorial, especialmente en ecosistemas megadiversos y  
fragmentados como la Amazonía ecuatoriana y los bosques andinos.  
DISCUSIÓN  
Los resultados obtenidos permiten interpretar que la biotecnología aplicada a la conservación de  
hábitats no debe entenderse únicamente como un conjunto de técnicas modernas, sino como un  
apoyo científico para enfrentar problemas ecológicos que ya son visibles en Latinoamérica y, de  
manera particular, en Ecuador. Herramientas como la genómica de la conservación, el ADN  
ambiental, el metabarcoding, los códigos de barras de ADN y la criopreservación muestran un  
aporte importante para mejorar la identificación de especies, fortalecer líneas base genéticas y  
detectar organismos que muchas veces no son registrados por métodos convencionales. Sin  
embargo, su verdadero valor no está solo en producir datos, sino en transformar esa información  
en decisiones concretas de manejo, restauración y protección territorial.  
En el caso ecuatoriano, esta discusión adquiere mayor relevancia debido a la presión creciente  
sobre ecosistemas estratégicos como la Amazonía, los bosques andinos, los bosques secos y las  
zonas de transición entre la cordillera y la llanura amazónica. La fragmentación de la selva  
ecuatoriana representa uno de los principales desafíos, ya que no solo implica pérdida de  
cobertura vegetal, sino también aislamiento de poblaciones, reducción de conectividad y  
alteración de procesos ecológicos. El análisis de las zonas prioritarias REDD+ de la Amazonía  
ecuatoriana evidenció un aumento general de la fragmentación entre 1990 y 2022, asociado con  
mayor número de parches, incremento del aislamiento y reducción de la cobertura natural,  
además de un patrón de fragmentación relacionado con el corredor vial norte-sur de la carretera  
E45 (39). Esto demuestra que la apertura vial, la expansión agrícola y otras actividades humanas  
pueden dividir progresivamente la continuidad entre ecosistemas amazónicos y andinos.Frente a  
este escenario, la biotecnología puede contribuir a reconocer con mayor precisión qué especies  
están presentes, qué poblaciones están más aisladas y qué zonas deberían priorizarse para  
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restauración o conectividad. Por ejemplo, el uso combinado de eDNA y censos visuales en la  
microcuenca del río Tena permitió registrar especies de anfibios acuáticos que no siempre pueden  
detectarse mediante observación directa (20). Esto confirma que los métodos moleculares son  
especialmente útiles en hábitats tropicales complejos, donde la alta diversidad, la baja  
detectabilidad de ciertas especies y las dificultades de acceso limitan los inventarios tradicionales.  
No obstante, estos resultados también sugieren que el eDNA y el metabarcoding no deben  
reemplazar completamente el trabajo de campo, sino integrarse con la taxonomía clásica, los  
recorridos visuales y el conocimiento local.  
En los bosques andinos, el problema de la fragmentación también es crítico, porque estos  
ecosistemas funcionan como espacios de conectividad entre áreas protegidas, gradientes  
altitudinales y especies de amplia movilidad. La información revisada sobre el oso andino muestra  
que las herramientas moleculares pueden ayudar a analizar diversidad genética y conectividad,  
pero también evidencia que las amenazas sobre la especie siguen siendo fuertes si no se aplican  
intervenciones directas (17). De manera similar, los estudios sobre corredores ecológicos en  
Ecuador indican que la conectividad no se conserva únicamente delimitando áreas protegidas,  
sino identificando rutas funcionales de movimiento, zonas de restauración y paisajes intermedios  
que permitan reducir el aislamiento poblacional (28-31). En este punto, la biotecnología se vuelve  
más útil cuando se combina con modelamiento espacial, cámaras trampa, análisis de cobertura  
vegetal, participación comunitaria y planificación territorial.  
Otro aspecto importante es que los resultados muestran una debilidad persistente en las  
bibliotecas de referencia molecular. En Ecuador, varios estudios advierten que la cobertura  
genética de muchos taxones todavía es incompleta, lo que limita la precisión de herramientas  
como el metabarcoding, el eDNA y los códigos de barras de ADN (16,19). Esta limitación es  
especialmente delicada en áreas megadiversas como Yasuní, donde se han registrado 458  
especies de peces de agua dulce, superando listados previos y demostrando que aún existe  
información biológica en construcción (19). Por ello, fortalecer las bases taxonómicas y genéticas  
no es un detalle técnico menor, sino una condición necesaria para que las herramientas  
biotecnológicas puedan aplicarse de manera confiable en conservación.  
A partir de lo revisado, se puede decir que la biotecnología ofrece un apoyo importante para la  
conservación y restauración de hábitats degradados, pero su utilidad no depende solo de aplicar  
nuevas técnicas. Para que realmente tenga impacto, debe relacionarse con políticas públicas,  
capacidades locales, financiamiento, gobernanza ambiental y acciones concretas dentro del  
territorio. En el caso de Ecuador, sobre todo en la Amazonía ecuatoriana y los bosques andinos,  
el reto no es únicamente incorporar tecnología, sino utilizarla para responder a problemas reales  
como la fragmentación, la pérdida de conectividad, la deforestación, los vacíos de información y  
el debilitamiento de poblaciones silvestres. Por ello, estas herramientas deben formar parte de  
una estrategia más amplia, en la que la evidencia molecular complemente la conservación in situ,  
la restauración ecológica, los corredores de conectividad y la toma de decisiones orientada a  
proteger la biodiversidad a largo plazo.  
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CONCLUSIONES  
A partir de la revisión realizada, se puede concluir que herramientas como la genómica de la  
conservación, el ADN ambiental, el metabarcoding, los códigos de barras de ADN y la  
criopreservación aportan de manera importante a la conservación de hábitats. Estas permiten  
mejorar la identificación de especies, fortalecer las líneas base taxonómicas y genéticas, detectar  
organismos que no siempre se registran con métodos tradicionales y conservar material biológico  
útil para futuros procesos de restauración. Sin embargo, su aporte no debe entenderse solo desde  
la parte molecular, sino como un complemento al trabajo de campo y a la información ecológica  
necesaria para tomar mejores decisiones ambientales.  
En Ecuador, especialmente en la Amazonía ecuatoriana, Yasuní, los bosques andinos y los  
corredores ecológicos, estas herramientas adquieren mayor importancia debido a las presiones  
que enfrentan estos ecosistemas. La fragmentación de la selva, la pérdida de cobertura boscosa,  
la expansión vial, las actividades productivas y el aislamiento de poblaciones silvestres muestran  
que la conservación necesita apoyarse en información molecular, ecológica y espacial. Esta  
integración puede ayudar a reconocer zonas críticas, priorizar acciones de restauración y  
mantener la conectividad entre hábitats estratégicos.  
Aunque existen avances importantes, la aplicación de la biotecnología en la conservación regional  
todavía enfrenta varios límites, como bibliotecas de referencia incompletas, falta de  
infraestructura especializada, escasa formación técnica, financiamiento limitado y poca  
articulación entre la investigación científica, la gestión ambiental y las políticas públicas. Por esta  
razón, la biotecnología no debe verse como una solución independiente, sino como una  
herramienta de apoyo que necesita integrarse con la conservación in situ, la restauración  
ecológica, la gobernanza territorial y la protección efectiva del territorio para contribuir a la  
permanencia de la biodiversidad a largo plazo.  
CONTRIBUCIONES DE AUTOR  
El autor fue responsable de la búsqueda y selección de la literatura científica, el análisis de la  
información, la redacción del manuscrito, la elaboración de los apartados de resultados, discusión  
y conclusiones, así como de la revisión final del artículo. Además, integró los enfoques  
relacionados con biotecnología, conservación de hábitats, conectividad ecológica y restauración  
de ecosistemas estratégicos. Centrado sobre todo en la región donde vive, buscando un análisis  
y dando a conocer cómo se encuentra situación hoy en día en la Amazonía acorde al tema.  
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https://files.worldwildlife.org/wwfcmsprod/files/Publication/file/3fgufbjpct_ESMF_Ecuad  
or_ASL_FINAL.pdf  
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